1. Primeiro é necessário ir no menu do lado esquerdo e então clicar em Automações > Automações de mensagens e então clicar no lápis do lado direito do fluxo de mensagem que você deseja vincular a sua instância de whatsapp.

2. Dentro da automação basta clicar em Salvar automação e em seguida aparecerá um pop-up mostrando as suas instâncias.
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Para vincular uma instância a sua automação basta clicar no quadrado do lado esquerdo da instância e em seguida clicar em Salvar automação.

Prontinho! Você acabou de vincular uma instância de WhatsApp a sua automação de mensagem.😄