Basta ir no menu do lado esquerdo e ir em Dados > Frete e lá configurar como nenhuma configuração de frete e em seguida clicar em salvar configuração de frete.
Caso deseje tirar os gastos de frete para dias anteriores contabilizados e deixar tudo zerado, basta reprocessar/sincronizar os dados do seu gateway, para os dias que você deseja.
Aqui está um artigo mostrando como fazer isso: Como sincronizar o Gateway manualmente? | Profitfy