Nós não integramos com o checkout diretamente, então não é preciso fazer a integração com o seu checkout.
Você apenas precisa ir em Dados > Taxas e Tarifas e lá configurar a taxa do seu checkout. Aqui está um artigo mostrando como fazer isso:
Como configurar a Taxa de Checkout? | Profitfy
Não se preocupe! Mesmo não integrando diretamente com o seu checkout conseguimos pegar os dados dele normalmente. Isso porque o checkout coloca as informações que precisamos na Loja Virtual, e como você integra a sua Loja conosco nós temos acesso a essas informações na sua Loja Virtual.